罕见疾病又称“孤儿病”,是一大类特殊病症的总称。根据世界卫生组织(WHO)的定义,罕见病患病人数占总人口的0.65‰~1‰的疾病。绝大多数罕见病都是遗传病,具有发病早、病情重、预后差等临床特征,给家庭和社会带来巨大负担。以个人基因组为基础的精准医学策略是研究罕见病的有效手段,近年来在疾病遗传机制、临床分型和治疗手段上不断突破,成效斐然。
一、研究现状及临床价值
超过80%的罕见病都是单基因遗传病。致病基因是认识罕见病发病机制的突破口,亦是实现精准医疗的源头与基础。在发现致病基因之前,罕见病的临床诊治往往是混沌的、黑暗的。而一旦发现致病基因,就能找到打开疾病黑箱子的“钥匙”。
致病基因既可直接用于临床基因诊断,也为研发对因治疗药物提供依据,具有巨大的临床价值。致病基因发现对于罕见病精准诊疗的意义可以从肺毛细血管瘤样病变/肺静脉闭塞病(PVOD/PCH)近几年的诊疗变化一见端倪。
2013年,PVOD/PCH的遗传学研究突破彻底改观了临床困境。研究发现,EIF2AK4是PVOD/PCH主要致病基因。
图片来源:Genetics of pulmonary hypertension in the clinic.
二、治疗及预防
近年来随着精准医学纳入国家发展战略,促进了罕见病诊治的发展,各类诊断技术特别是第二代基因测序技术的成熟和广泛临床使用,极大提高了罕见病的确诊率。
类似前文中提及PVOD/PCH因致病基因发现改变临床诊疗的例子还有很多。过去10年间,高通量测序技术的进步颠覆了既往遗传学研究范式,显著提升了发现罕见病遗传突变的效率。
研发针对致病基因的靶向治疗药物,是罕见病精准医疗的最后一环,也是最难的一环。目前,仅有约1%的罕见病有有效治疗药物。根据罕见病的发病特点,注意以下几点,可以一定程度上预防罕见病:
1、近亲结婚可增加罕见病的发生率
国家婚姻法禁止三代以内的近亲结婚。近亲结婚时,夫妇双方携带相同的隐性致病基因的可能性大,而使后代遗传病的发病率升高。
2、鼓励适龄生育
高龄(≥35岁)产妇胎儿染色体异常几率升高。
3扩展性携带者筛查
孕前或者早孕期进行遗传咨询,扩展性携带者筛查,对携带共同致病基因的高危夫妻进行植入前产前诊断和产前诊断。
4、出生后早诊断、早治疗,提高患儿生活质量
三、华测罕见病检测套餐
华测艾普紧跟研究热点,
推出遗传类全外显子组测序检测套餐,
专注发掘罕见病致病基因,
致力于让全球“孤儿病”从此不孤独。
检测覆盖2018年6月和2021年9月国家分别发布的两批罕见病目录,例如:
序号 |
中文名称 |
英文名称 |
1 |
21-羟化酶缺乏症 |
21-Hydroxylase Deficiency |
2 |
白化病 |
Albinism |
3 |
Alport 综合征 |
Alport Syndrome |
4 |
肌萎缩侧索硬化症 |
Amyotrophic Lateral Sclerosis |
5 |
Angelman氏症候群(天使综合征) |
Angelman Syndrome |
6 |
精氨酸酶缺乏症 |
Arginase Deficiency |
7 |
窒息性胸腔失养症 |
Asphyxiating Thoracic Dystrophy /Jeune Syndrome |
8 |
非典型溶血性尿毒症 |
Atypical Hemolytic Uremic Syndrome |
9 |
自身免疫性脑炎 |
Autoimmune Encephalitis |
10 |
自身免疫性垂体炎 |
Autoimmune Hypophysitis |
11 |
自身免疫性胰岛素受体病 |
Autoimmune Insulin Receptopathy |
12 |
β-酮硫解酶缺乏症 |
Beta-Ketothiolase Deficiency |
13 |
生物素酶缺乏症 |
Biotinidase Deficiency |
14 |
心脏离子通道病 |
Cardic Ion Channelopathies |
15 |
原发性肉碱缺乏症 |
Carnitine Deficiency |
16 |
Castleman病 |
Castleman disease |
17 |
腓骨肌萎缩症 |
Charcot-Marie-Tooth Disease |
18 |
瓜氨酸血症 |
Citrullinemia |
19 |
先天性肾上腺发育不良 |
Congenital Adrenal Hypoplasia |
20 |
先天性高胰岛素性低血糖血症 |
Congenital Hperinsulinemic Hypoglycemia |
21 |
先天性肌无力综合征 |
Congenital Myasthenia Syndrome |
22 |
先天性肌強直 |
Congenital Myotonia Syndrome / Non-Dystrophic Myotonia |
23 |
先天性脊柱侧弯 |
Congenital Scoliosis |
24 |
冠状动脉扩张病 |
Coronary Artery Ectasia |
25 |
先天性纯红血球再生障碍性贫血 |
Diamond-Blackfan Anemia |
26 |
Erdheim-Chester 病 |
Erdheim-Chester Disease |
项目简介
全外显子组测序(WES)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。WES发现致病性基因变异机率相对其他更高的测序方法,凭借其有全面性、有效性、 极高性价比等优势,被广泛应用于遗传异质性疾病、非典型临床表型疾病、罕见病等。
应用优势
特征 |
全基因组测序(WGS) |
全外显子组测序(WES) |
基因panel |
单个基因 |
测序区域 |
全基因 |
>2万基因 |
几个至几百个基因 |
1个基因 |
致病基因覆盖 |
基本均匀覆盖全基因组 |
覆盖蛋白编码基因 |
覆盖目标蛋白编码基因 |
完全覆盖目标基因 |
偶然发现 |
可能 |
可能 |
取决于所选的基因 |
不可能 |
检测周期 |
(多用于科研) |
(3-6周) |
(4-6周) |
(1-2周) |
适应症 |
遗传异质性疾病,非典型临床表征疾病、非编码变异以及结构重排所致疾病 |
遗传异质性疾病、非典型临床表型疾病、罕见病
|
遗传异质性疾病 |
临床特征明显的疾病 |
样本要求
EDTA采血管(紫帽管)/2ml
口腔拭子/2管
参考文献
[1] J Clin Pediatr Vol.42 No.1 Jan. 2024.2.27.
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