万物复苏,春意盎然。春天是一年最美好的季节,也是一些传染病的高发阶段,常见的传染病有流行性感冒、麻疹、水痘、腮腺炎等,主要通过呼吸道传播、飞沫传播、密切接触传播。
找准感染源,更好辅助诊断,是治疗疾病的关键。华测艾普病原微生物检测包含多种检测手段(tNGS和mNGS)和多种高发病原体疾病检测(呼吸道、分枝杆菌、妇科疾病)项目。
一、tNGS系列产品
病原微生物靶向检测(tNGS):通过设计特异性引物,采用超多重PCR建库体系,对目标病原体核酸序列及耐药基因进行靶向扩增富集,再利用高通量测序方法进行检测,实现病原微生物的广谱、精准检测,致力于辅助临床诊疗。
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检测项目
tNGS已成为呼吸道感染病原体诊断的研究热点,也可应用于其他系统感染:如中枢神经系统感染、血流感染、关节感染等。
目前tNGS一般应用于院内感染的一线筛查,不受人源干扰,临床应用场景主要覆盖以下场景:
1、临床高度怀疑感染,但缺乏病原学依据,需要明确病原体,从而实现精准治疗;
2、临床治疗效果欠佳,需要明确感染菌株是否为耐药菌株,调整治疗方案;
3、感染住院患者的初筛,涵盖:急诊留观、普通病房、重症监护室等;
4、不明发热待查。
项目优势
广丨靶标覆盖临床上95%以上的常见病原体
高丨有效去除人源及背景菌,灵敏度高
快丨测序时间大大缩短,时效性快
准丨聚焦病原体耐药基因与表型一致较高的基因
适用人群
常见病原体感染患者
混合感染患者
感染原因不明患者
传统病原检测阴性患者
二、mNGS系列产品
病原宏基因组二代测序(mNGS)是不基于培养,直接从环境/临床样品中提取全部微生物的DNA,利用基因组学的研究策略研究环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能,可广泛分析临床样本微生物组(细菌、真菌、病毒)的高通量测序方法。mNGS技术对免疫抑制人群和重症感染人群的病原学诊断起到了突破性作用。其优点在于不需要培养,不需要前提假设,能够基本达到对细菌、病毒、真菌和寄生虫等所有已知基因序列的病原微生物全覆盖,且具有检测新发病原体和罕见病原的能力。
检测项目
目前主流临床适用场景:
1、患者表现为发热或发热症候群,病因未明确(符合不明原因发热定义),考虑感染或不除外感染,但规范性经验抗感染治疗无效,在应用常规技术检测的基础上,开展mNGS产品检测。
2、各种原因导致患者急危重症表现,不除外感染所致,或考虑继发或并发危及生命的严重感染,在常规检测的基础上,开展mNGS产品检测。
3、免疫受损患者疑似继发感染,常规病原学检查未能明确致病原或/和规范性经验抗感染治疗无效,建议进一步完善常规病原学检测的同时,或在其基础上,开展mNGS产品检测。
4、疑似局部感染,病原学诊断未明确、不及时处理则后果严重时,在常规检测的基础上,开展mNGS产品检测。
5、高度疑似感染性疾病,但病原学诊断未明确且常规抗感染治疗无效,建议进一步完善常规病原学检测、处理原发感染灶,调整经验抗微生物治疗方案的同时开展mNGS检测。
6、慢性感染,或慢性疾病不除外感染,尤其是二者临床表现相似、难以鉴别时,病情严重或抗感染治疗疗效不佳需要明确病因,建议在完善常规检测、调整经验治疗的同时开展mNGS产品检测。
7、其他患者疑似特殊病原体感染或从相关流行病学角度考虑需要进行mNGS产品检测。
项目优势
✓不依赖阳性培养物
✓无偏倚广谱检测
✓灵敏、准确、快速
✓混合感染及新发病原体
样本要求
参考文献
[1] 《临床微生物手册》:第 11 版 /(美)詹姆斯 H. 约根森,(美)迈克尔 A. 普法勒主编;王辉等译 . 北 京:中华医学电子音像出版社,2017.6.
[2] 《中华传染病杂志》编辑委员会. 中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识[J]. 中 华传染病杂志, 2020, 38(11):681-689.
[3] Gaston DC, Miller HB, Fissel JA, Jacobs E, Gough E, Wu J, Klein EY, Carroll KC, Simner PJ. Evaluation of Metagenomic and Targeted Next-Generation Sequencing Workflows for Detection of Respiratory Pathogens from Bronchoalveolar Lavage Fluid Specimens. J Clin Microbiol. 2022 Jul 20;60(7):e0052622. doi: 10.1128/jcm.00526-22. Epub 2022 Jun 13. PMID: 35695488; PMCID: PMC9297812.
CTI华测艾普满分通过2023年“全国血液微生物cfDNA宏基因组高通量测序室间质量评价预研活动”
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