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世界肾脏日 | 文献解读:揭秘原发性肾小球肾炎的代谢组学Meta分析

2024-04-17 06:32:49 214

  原发性肾小球疾病(Primary glomerular diseases,PGDs)是导致慢性肾病的主要原因,该类型疾病在早期阶段往往没有明显症状,故其临床诊断具有一定的挑战性。


  临床上通常依赖活检来确定PGDs,但活检作为一种创伤性检测,常伴随疼痛、小血肿等并发症风险,因此一种不依赖活检的标志物检测成为了实际临床需求。


  肾脏与代谢组学天然相关,PGDs患者尿液样本中的代谢物变化,在临床上有潜力作为疾病的诊断或预后的标志物。


  01研究方法


  本研究主要为Meta分析(Meta-analysis),通过全面文献检索的模式,获取临床尿液样本代谢组学相关数据进行统计学分析,进一步挖掘PGDs相关亚型的特定代谢物种类,关联分析这些代谢物功能通路与该类疾病的诊疗相关性。


  02研究结果


  1.Meta分析包含了224篇文献,筛选后纳入了11个研究结果进行分析;


  2.在1154个尿液样本中,分析出275种失调代谢物,其中498例IgA肾病(IgAN)样本含83个,182例局灶节段性肾小球硬化(FSGS)样本含46个,201例膜性肾病(MN)含92个,243例微小病变肾病(MCD)含39个;


  3.数据挖掘发现,IgAN疾病的标记性代谢物为2-戊酮、二甲胺、吡咯和4-庚酮,MN疾病包含葡萄糖、丙酮酸、甲基丙二酸、亮氨酸、酪氨酸、异丁酸、乙醇酸和富马酸,FSGS包含3-羟基异戊酸、葡萄糖、柠檬酸,MCD包含葡萄糖、柠檬酸。


  03研究结论


  尿液代谢物组成的分析可以直接反映肾功能,比如分析发现葡萄糖是PGD患者尿液样本中的主要代谢物之一,但相关患者并没有糖尿病,故此类标记物颇具临床意义,联系到此类疾病多存在肾小管缺陷,其可能导致葡萄糖、氨基酸类在尿液中排泄增加。


  柠檬酸、富马酸和丙酮酸的失调,表明PGD中线粒体机制受损,证实了线粒体相关代谢在肾脏疾病中存在紊乱。


  对不同PGD亚型的研究发现相关亚型存在特定代谢物谱,这些发现为PGD的诊断和治疗提,供了一些极具价值的标志物,在进行PGD早筛早诊方面具有潜在临床意义。


  04研究结果展开


  图1.META研究开展流程图,涵盖鉴别、筛选、资格提取和纳入四个主要步骤


  图2.原发性肾小球疾病(PGDs)各亚型META分析筛选流程及结果


  图3.基于Amanida(一种代谢组学非积分数据分析R语言程序包)的PGDs异常代谢物挖掘


  a.火山图显示PGDs尿样样本中呈现异常上升和下降的代谢物种类。

  b.显示代谢物的投票计数结果,展示不同研究中的偏差或一致性。

  c.基于投票计数方法进行的定性分析,显示化合物在总体的上调或下调。


  图4.维恩图展示PGD亚型(IgAN、FSGS、MN和MCD)之间共享或独有的代谢标记物


  图5.PGN尿液样本中差异代谢物组的富集分析


  a.气泡图显示差异代谢物分组富集分析。

  b.气泡图显示差异代谢物所在通路分析。

  c.柱状图显示差异代谢物亚群富集分析。

  d.饼状图显示差异代谢物亚群富集分析。


  图6.基于差异代谢产物、相关基因与代谢通路的相互作用分析。


  圆形代表基因,六边形代表代谢产物,不同颜色代表不同代谢通路。


  05总结与启发


  该篇文献发表于Scientific Reports(IF=5),ag真人平台官方可以借鉴到:


  1.该课题为一项基于文献Meta分析的研究,所有数据均来自于公共数据库资源。

  2.结合实际临床科研问题开展课题,利用已有代谢组学数据,挖掘具有潜在临床价值的生物标记物。


  该文献主要开展数据挖掘工作,基于肾病患者尿液代谢组学研究已有数据,进一步统计分析,结合实际临床问题,提炼升华其相关价值与意义。该类型研究并未实际涉及传统的“湿实验”,主要基于文献分析,对于临床科研老师开展类似研究具有实际借鉴意义。


  参考文献


  Roointan,A.,Ghaeidamini,M.,Shafieizadegan,S.,Hudkins,K.L.,&Gholaminejad,A.(2023).Metabolome panels as potential noninvasive biomarkers for primary glomerulonephritis sub-types:meta-analysis of profiling metabolomics studies.Sci Rep,13(1),20325.doi:10.1038/s41598-023-47800-7.

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