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文献解读 | 浅谈重度抑郁症患者肠道微生物的多组学研究

2023-07-16 16:00:00 569

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  据中国精神卫生调查显示,中国成人抑郁障碍终生患病率为6.8%,其中抑郁症为3.4%,目前有近5000万人饱受抑郁症困扰。抑郁症中,重度抑郁症(MDD)具有较高的发病率,是一种严重的精神障碍,会导致自杀行为。世界卫生组织(WHO)将MDD列为对健康造成最大损失的单一因素。


  01 研究背景


  重度抑郁症(MDD)是一种异质性疾病,机制尚未明确,已有研究表明,遗传学、神经内分泌学、神经免疫学、脑区结构和功能异常,在MDD的病理生理中都发挥重要作用,因此深入了解MDD的发病机制非常具有临床意义。


  据相关证据显示,肠道菌群对神经精神疾病发病具有影响,MDD与微生物菌群-肠道-脑(MGB)轴功能紊乱之间存在密切关联。本期文献解读探讨MDD患者中微生物宏基因组、免疫学、代谢组学和脑结构之间的联系。


  02 研究方法


  ag真人平台官方招募了未接受药物治疗的重度抑郁症(MDD)患者,以健康患者作为对照组,收集他们的微生物组学、代谢组学、炎症因子和MRI扫描的数据。随后,进行相关性分析,探索MDD中各个组学之间的关系。


  03 研究结果


  肠道菌群在MDD中的发生发展中存在多方面影响。肠道菌群的改变与代谢紊乱、免疫激活和大脑灰质体积的变化都有相关。推测NLRP3炎症小体在MGB轴中起着重要的链接作用。

 


  图1 MDD患者肠道微生物组的变化


  在图a-c,宏基因测序鉴定出94个不同的微生物,可以区分MDD患者和健康患者。
  图a ,热图显示MDD患者和健康患者之间的菌群差异。MDD患者中54个上调(左侧),40个下调(右侧)。
  图b-c,上调微生物属于厚壁菌门(Firmicutes)(57.10%)、放线菌门(Actinobacteria)(28.84%)和拟杆菌门(Bacteroidetes)(14.03%),下调微生物属于厚壁菌门(Firmicutes)(85.13%)和拟杆菌门(Bacteroidetes)(14.80%)。
  图d,主成分分析(PCA)显示MDD患者的肠道微生物组成与健康患者明显不同。(n = 24,重度抑郁症组;n = 26,健康对照组)。
  图e 主成分分析(PCA)显示MDD患者和健康患者之间微生物功能差异。

 


  图2 MDD患者肠道微生物组的变化


  图a LDA分数显示MDD患者和健康对照组之间细菌分类组成的差异(LDA = 2)。红色柱表示在MDD患者中富集的分类群,绿色柱表示在健康对照组中丰富的细菌分类群。


  图b MDD患者组(红色)相对于健康组(蓝色)的肠道微生物功能差异。
  图c 在门水平上,相对于健康对照组,MDD患者组中厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)的丰度减少,而放线菌门(Actinobacteria)在MDD患者中显著高于健康对照组。


  图d-e 使用随机森林模型,筛选出6个生物标记物进行MDD患者的预测。ROC曲线下面积(AUC)为0.98(95% CI:0.961-1)。

 


  图3 MDD患者和健康对照组之间显示显著差异的代谢物

        图a 通过偏最小二乘回归建立模型,清晰地区分了MDD患者和健康对照组。这表明MDD患者的代谢模式与HC组有所不同。


  图b 火山图显示两组之间有34个显著不同的代谢物。红色点代表增加的代谢物,绿色点表示减少的代谢物。点的大小表示投影的变量重要性(VIP)。纵坐标表示显著性水平。


  图c 气泡图显示了两组之间的KEGG通路。点的大小表示通路中的代谢物数量。红色点比蓝色点更显著。前三个通路的代谢物在图b和c中均有标记。


  图d-e MDD患者组中共有29个上调的代谢物,5个下调的代谢物。大部分上调的代谢物属于脂类和类脂分子(24.14%)、核苷酸及其衍生物(17.24%)、维生素(10.34%)和有机酸及其衍生物(10.34%);而下调的代谢物主要属于氨基酸及其衍生物(60.00%)。

 


  图4 MDD患者和健康对照组(HCs)之间的炎症因子血浆水平和灰质体积的差异

      图a 与健康对照组相比,MDD患者的IL-1β水平显著升高(858.30 ± 432.70 pg/ml vs. 359.52 ± 160.63 pg/ml)。IL-6和TNF水平没有显著变化(901.03 ± 617.92 pg/ml vs. 707.31 ± 584.07 pg/ml, 514.12 ± 194.41 pg/ml vs. 414.87 ± 288.36 pg/ml)。


  图b 与健康对照组相比,MDD患者在左侧额下回(IFG)的GMV显著减少,在左侧苍白球、左侧楔前叶、左侧下顶叶(IPL)和右侧扣带回(CG)的GMV增加。冷色表示MDD患者与健康对照组相比灰质体积减少,暖色表示灰质体积增加。IFG为额下回,IPL为顶下叶,CG为扣带回。


  图5 胃肠微生物组与代谢物、IL-1β、GMV、MDD患者的临床特征之间的相关性图5展示了94个肠道微生物、IL-1β、34种代谢物、5个脑区以及6个临床指标的皮尔逊相关系数热图。


  横轴依次为临床指标(包括年龄、性别和临床评分)、IL-1β、代谢物(主要包括有机酸及其衍生物、维生素、脂类和类脂分子等)以及脑区的GMV。纵轴为94个肠道微生物。红色方块表示正相关关系,蓝色方块表示负相关关系。


  方块上标注统计学显著性(*p < 0.05, **p < 0.01)。HAMD-17为17项汉密尔顿抑郁量表,HAMA为汉密尔顿焦虑量表,IDS-SR30为30项抑郁症状自评量表,QIDS-SR16为16项快速抑郁症状自评量表,IFG为额下回,IPL为顶下叶,CG为扣带回。

 


  04 总结与启发


  本文研究肠道菌群与代谢紊乱、免疫激活和大脑灰质体积之间的关系。
  研究者通过宏基因组测序检测肠道微生物菌群,LC-MS/MS检测血液代谢物,ELISA检测血液炎症因子IL-1β、IL-6和TNF,磁共振成像(MRI)扫描检测大脑中灰质体积(GMV)。


  为了确定MDD患者肠道菌群、代谢物、炎症细胞因子和灰质体积之间的关联,研究者使用R版本3.4.3(Psych软件包)中的Pearson相关分析构建了相关分析的热图,最后得出肠道菌群在MDD中的作用是多因素的。


  肠道菌群的改变与代谢紊乱、免疫激活和大脑灰质体积的变化相关。推测NLRP3炎症小体在MGB轴中起着重要的链接作用。这些发现为抑郁症潜在的病理机制提供了新的见解。多组学的这种初步分析有助于开发抑郁症的诊断或治疗工具。


  华测艾研多组学研究中心具有丰富的代谢组学科研服务经验,包含非靶向代谢组、靶向代谢组、脂质组学、代谢流组学等;以及高通量测序,如宏基因组、16s/18s/ITS扩增子测序、单细胞转录组等测序服务,帮助客户实现多组学联合分析,赋能高分文章。


  参考文献
  Zhao H, Jin K, Jiang C, et al. A pilot exploration of multi-omics research of gut microbiome in major depressive disorders.Transl Psychiatry. 2022;12(1):8. Published 2022 Jan 10. doi:10.1038/s41398-021-01769-x

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